Rakenduste osas saab magnetpalle kasutada laste intellektuaalseks arenguks, aidates neil mõista geomeetrilisi kujundeid ja ruumilisi struktuure; neid saavad kasutada ka täiskasvanud stressi leevendamiseks, võimaldades neil magnetpallidega mängides lõõgastuda; lisaks kasutatakse magnetkuule teaduslikes katsetes, et demonstreerida magnetväljade ja jõudude põhiprintsiipe.
Magnetkuulide kasutamisel tuleb arvestada järgmiste punktidega: Esiteks, kuna magnetkuulidel on tugev magnetism, vältige nende paigutamist elektrooniliste seadmete lähedusse, et vältida nende normaalset tööd häirimist; teiseks, magnetpallid ei sobi väikelastele, kuna juhuslik allaneelamine võib põhjustada tõsiseid terviseprobleeme; lõpuks vältige magnetkuulikeste pikaajalist kokkupuudet kõrgete temperatuuridega, kuna see võib mõjutada nende magnetilisust.